На каналах гранулярной ЭПС рибосомы синтезируют белки, на мембранах гладкой ЭПС синтезируются липиды и углеводы. Вещества, синтезированные в ЭПС, транспортируются в комплекс Голъджи и накапливаются в его цистернах. Там эти вещества подвергаются химическим изменениям, и происходит образование сложных комплексов веществ. В комплексе Гольджи также образуются лизосомы.