Дано целое число. Если оно равно 3, то необходимо увеличить его на 3, иначе возвести в квадрат.

Const
n=10;
var
a:array[1..n]of integer;
i,j,buf:integer;
begin
   for i:=1 to n do
      begin
         a[i]:=random(3);
         write(a[i]:4);
      end;
{сортирую по возрастанию}
 for i:=1 to n-1 do
    for j:=i+1 to n do
       if a[i]<a[j]then
         begin
               buf:=a[i];
                a[i]:=a[j];
                a[j]:=buf;
         end;
{пересылаю нули в конец масива}
for i:=1 to n-1 do
    for j:=i+1 to n do
       if a[i]=0 then
         begin
               buf:=a[i];
                a[i]:=a[j];
                a[j]:=buf;
         end;
for i:=1 to n do
   write(a[i]:4);
end.

Ты объявила массив от 1 до 10, а в конце в цикле пытаешься обратиться к элементу с индексом 0!
 (for i:=0 to m do
begin for j:=0 to n do)
Ну и куча мелких недочетов еще тут есть

const
  n=5;
  m=6;
var
  a:array[1..n,1..m] of integer;
  i,j: integer;
begin
writeln('Исходный массив:');
for i:=1 to n do
   begin
   for j:=1 to m do
     begin
     a[i,j]:=random(10);
     write(a[i,j]:4);
     end;
   writeln;
   end;
writeln('Измененный массив:');
for i:=1 to n do
   begin
   for j:=1 to m do
     begin
     if a[i,j]=0 then a[i,j]:=i+j;
     write(a[i,j]:4);
     end;
   writeln;
   end;
end.