Исследованы в 1957, 1959—1961 годах семииреченской археологической экспедицией (рук. К.Акишев). 31 большой и маленький могильник, 21 из которых покрыты камнем, 10 — пластом из щебня и глины. Условно делятся на северные и южные. Самые крупные (2-й и 3-й) диаметром от 45 до 105 м, высота 6—17 м. Средние курганы соответственно — 25—38 м, 5—6 м. Маленькие — 6—18 м, 0,8—2 м. Исследования 18 могильников разной величины дали ценные научные сведения о социальных группах, хозяйстве, быте, обычаях, религиозных убеждениях, архитектуре, оружии и снаряжении саков. В 6 из 20 курганов удлинённые участки ограждены цепью из каменных плит и мелких камней. На множестве плит высечены изображения горных коз, кабанов, волков и других зверей, а также различные метки. Встречаются символы солнца и круги, изображающие казахскую тамгу «глаз». Курганы были не только местом погребения, но и местом проведения религиозных обрядов. Обнаружены сложные подземные ходы. В 6 больших курганах общая длина катакомб — 55 м, высота проходов — 1,68 м, шир. — 0,8 м. Могильники малых курганов вырыты в виде простой ямы иногда с боковым каменным ящиком. Средние напоминают юрту. Большие могильники изнутри отделаны деревом и относятся к уникальным архитектурным памятникам древней эпохи. На строительство большого кургана уходило до 50000 м3камня и глины. Брёвна для отделки заготавливались из тянь-шанской ели в Заилийском Алатау в 200—250 км от места, сплавлялись по реке. Большие могильники (длина более 10 м, высота 4—5 м) предназначались для погребения вождей и военачальников сакских племен. В средних хоронили военачальников ниже рангом и известных войной, а могильники поменьше отводились рядовым воинам и простым людям. При раскопках обнаружены короткий меч-акинак, наконечники копий, часть деревянного щита, железная пряжка подпруги, 4 агатовых и 2 золотых бус. Курганы Бесшатыр относятся к VI—V векам до н. э.
Комплекс захоронений состоит из множества курганов и могильников. На площади в 2 км² сосредоточено 18 царских курганов диаметром от 8 до 70 метров и высотой от 2 до 20 метров. Западнее царских гробниц с севера на юг тянется цепь из 45 каменных оград, на которых выбиты рисунки животных. Учёные предполагают, что это — ритуальная площадка некрополя. Под насыпями устроены сложные по конструкции усыпальницы из тянь-шаньской ели. Рядом с Бесшатыром находятся сакские могильники Кзылауыз, Алтын-Эмель, Карашокы. В 3 км юго-восточней расположены более поздние захоронения: могильники Усуней Бесшатыр II, состоящие из 33 курганов, чуть дальше — могильник Калкан I, насчитывающий 118 погребальных сооружений, а в районе перевала Алтынэмель — одноименные могильники из 36 курганов.
