Природные условия Вологодской области характеризуются холмисто-равнинной поверхностью, подвергавшейся неоднократному воздействию скандинавско-кольского оледенения, перекрывшего своими ледниковыми и озерно-ледниковыми отложениями более древние коренные породы, умеренно-континентальным, достаточно влажным, местами даже избыточным климатом, довольно густой речной сетью и обилием озер и болот на западе и северо-западе, подзолистыми и торфяно-подзолистыми почвами, таежной растительностью из хвойных и мелколиственных деревьев, лугами и болотами.Центром организации и проведения научных исследований природы является Дарвинский государственный природный биосферный заповедник, образованный в 1945 году с целью изучения влияния искусственного водоема - Рыбинского водохранилища на природные ландшафты Молого-Шекснинского междуречья. Площадь заповедника составляет 112,6 тыс. га, из которых 67,2 тыс. га приходится на сушу и 45,4 тыс. га - на акваторию водохранилища. Заповедник расположен на стыке Вологодской, Ярославской и Тверской областей. 45,1 тыс. га его территории относятся к Вологодской области.Животные, занесенные в Красную книгу России и подлежащие охране
на территории Вологодской области
1. Насекомые: мнемозина (черный аполлон).
2. Рыбы: подкаменщик обыкновенный.
3. Птицы: черный аист, скопа, орлан-белохвост, беркут, змееяд, сапсан, пискулька
4. Млекопитающие: выхухоль. Редкие животные Вологодской области
1. Рыбы: семга, форель, нельмушка.
2. Земноводные: тритон гребенчатый, чесночница.
3. Пресмыкающиеся: веретенница, ящерица прыткая, уж обыкновенный, медянка.
4. Птицы: гагара краснозобая, поганка черношейная, цапля серая, лебедь-кликун, гусь серый (на гнездовье), подорлик большой, осоед, кобчик, чеглок, журавль серый, куропатка серая, кроншнеп средний, гаршнеп, кулик-сорока, крачка малая, филин, зимородок, дятел зеленый, оляпка, дрозд черный, славка ястребиная, дубонос.
5. Млекопитающие: бурозубка крошечная, ночница усатая, кожанок северный, росомаха, летяга, лемминг лесной.