В городе Пиза изучал философию и медицину. Вернувшись в Ареццо, за свои заслуги в области исследования природы получил назначение на должность домашнего врача от Тосканского принца Фердинанда II, а также членство в Academia del cimento, также Реди являлся главным фармацевтом герцогства. Реди основательно изучил все труды по анатомии и физиологии, которые были известны до него.Принимал участие в составлении словаря «Academia della Crusca». Все его оригинальные печатные труды вышли во Флоренции в 1664—90 г. (7 томов) и Венеции в 1712—28 г. (7 томов). Самые известные:«Опыты о размножении насекомых» (1668 г.)«Наблюдения над животными, живущими в живых же животных» (1684 г.)Обе книги были непосредственно связаны с обсуждением возможности самопроизвольного зарождения организмов. Реди также написал ряд трудов по медицине, опубликовал книгу о действии змеиного яда.Основные работы проводил по изучению зарождения организмов, биологии паразитов человека и животных. В труде «Опыты о размножении насекомых» (1668) Реди, не допускающий мысли о возможности самозарождения жизни, экспериментально опроверг распространённое в то время представление, что существуют живые творения, самозарождающиеся в нечистотах, первым доказав, что личинки мух развиваются только из отложенных мухами яиц. В процессе опыта Реди положил по куску протухшего мяса в два сосуда: один из них он оставил открытым, а второй плотно закрыл марлей. В первом сосуде, куда мухи имели свободный доступ, на мясе появились личинки, вылупившиеся из маленьких яичек. Во втором сосуде, соотвественно, личинок не было. Таким образом, мухи — сделал вывод ученый — не зарождались в мясе, но появлялись из яиц, отложенных другими мухами.В другой работе (1684) он описал форму и строение некоторых паразитов (преимущественно ленточных и круглых червей), обитающих в кишечнике человека и животных, а также органы размножения у самок и самцов аскарид для доказательства того, что они размножаются половым путём. Однако Реди не мог обнаружить яиц некоторых паразитов и ошибочно допустил возможность их образования из «пластических соков» организма хозяина.При опытах с действием змеиного яда; доказал, что яд гадюки безвреден, если его проглотить.Интересовался также метаморфозами насекомых и биологией червей.