Флейтовый-флейтовый - функция ударения

Флейтовый на е, так как флейта

Не о том вопрос.
акцентология изучает особенности и функции ударения.
Целый ряд вариантов ударения связан с профессиональной сферой употребления. Есть слова, специфическое ударение в которых традиционно принято только в узкопрофессиональной среде, в любой другой обстановке оно воспринимается как ошибка.
мы говорим - флЕйтовый, а у музыкантов допускается и флейтОвый